174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1567 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
365 aa  712    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 
385 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 
385 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  45.9 
 
 
384 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  39.27 
 
 
382 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  43.38 
 
 
383 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  45.9 
 
 
384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  43.38 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 
384 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  43.38 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  43.41 
 
 
384 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  41.36 
 
 
382 aa  250  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  42.2 
 
 
389 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  41.07 
 
 
381 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  44.11 
 
 
389 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  43.77 
 
 
384 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  40.48 
 
 
387 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  44.68 
 
 
380 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  38.07 
 
 
395 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  39.58 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  40.24 
 
 
380 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  39.49 
 
 
383 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  39.44 
 
 
385 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23770  MFS metabolite transporter  41.87 
 
 
354 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  37 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  36.24 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  37.99 
 
 
389 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  37.99 
 
 
389 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  37.25 
 
 
389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  37.69 
 
 
389 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  37.32 
 
 
391 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  34.78 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  37.32 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  38.19 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  37.04 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  37.8 
 
 
391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  36.99 
 
 
402 aa  212  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 
396 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 
389 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
405 aa  209  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  35.14 
 
 
389 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  35.58 
 
 
389 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  35.71 
 
 
365 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  38.41 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  32.2 
 
 
387 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  33.33 
 
 
422 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  34.18 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  32.79 
 
 
384 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  31.83 
 
 
385 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
385 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  31.73 
 
 
386 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  32.01 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.24 
 
 
385 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.98 
 
 
385 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.97 
 
 
385 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
401 aa  155  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 
396 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.25 
 
 
386 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.12 
 
 
386 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.84 
 
 
379 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.05 
 
 
379 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.05 
 
 
379 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.05 
 
 
379 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.05 
 
 
379 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.75 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.93 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  32.39 
 
 
397 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  31.89 
 
 
395 aa  133  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  30.27 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.27 
 
 
379 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.27 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.27 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  30.27 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  30.27 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.27 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.78 
 
 
393 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.48 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.27 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.15 
 
 
397 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.82 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.12 
 
 
342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.04 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  23.28 
 
 
391 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  28.1 
 
 
380 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  26.23 
 
 
395 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  27.73 
 
 
404 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  27.6 
 
 
402 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
402 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  26.65 
 
 
407 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  25.96 
 
 
388 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2283  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
362 aa  100  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
397 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  27.06 
 
 
386 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  28.66 
 
 
400 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  26.65 
 
 
387 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0045  putative MFS metabolite transporter  27.91 
 
 
393 aa  92.8  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>