140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0976 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  100 
 
 		 387 aa  782    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  88.57 
 
 		 385 aa  682    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 365 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  47.31 
 
 		 422 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 385 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  35.51 
 
 		 395 aa  212  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  36.02 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  34.36 
 
 		 383 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 384 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  34.86 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  32.28 
 
 		 384 aa  183  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 390 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  32.2 
 
 		 365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  30.77 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 384 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 390 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 384 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  32.35 
 
 		 389 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  31.3 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 391 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 389 aa  166  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  32.31 
 
 		 384 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 380 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 402 aa  155  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23770  MFS metabolite transporter  35.12 
 
 		 354 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  31.23 
 
 		 380 aa  153  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 387 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  31.27 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.38 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.89 
 
 		 385 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.89 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.61 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.16 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.16 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.16 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.16 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2283  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  24.8 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.25 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  25.4 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.93 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.73 
 
 		 379 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.51 
 
 		 383 aa  86.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.47 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.17 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.47 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  25.13 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  23.58 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.67 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  25.8 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  25.8 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.8 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  26.38 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.38 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.38 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  21.68 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.09 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.46 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>