129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2761 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  100 
 
 
380 aa  746    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  78.02 
 
 
397 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  73.28 
 
 
386 aa  551  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  72.3 
 
 
386 aa  547  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  63.95 
 
 
385 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  63.68 
 
 
385 aa  494  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  63.95 
 
 
385 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  62.11 
 
 
379 aa  485  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  63.83 
 
 
379 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  63.13 
 
 
379 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  63.56 
 
 
379 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  63.56 
 
 
379 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  63.56 
 
 
379 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  63.3 
 
 
379 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  66.4 
 
 
383 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  62.89 
 
 
379 aa  471  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  62.63 
 
 
379 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  62.63 
 
 
379 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  62.63 
 
 
379 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  62.63 
 
 
379 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  62.63 
 
 
379 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  62.63 
 
 
379 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  62.63 
 
 
379 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  42.71 
 
 
395 aa  286  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  43.61 
 
 
393 aa  276  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  42.44 
 
 
396 aa  275  8e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  35.77 
 
 
380 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  42.55 
 
 
342 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.77 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 
402 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  31.73 
 
 
388 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  35.58 
 
 
387 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
387 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  33.24 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  31.52 
 
 
402 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  31.56 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
406 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  31.84 
 
 
400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 
405 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 
401 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  29.92 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  30.52 
 
 
365 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  28.85 
 
 
387 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
385 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  31.73 
 
 
395 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  31.58 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  31.67 
 
 
380 aa  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  29.33 
 
 
389 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  30.56 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.84 
 
 
395 aa  116  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  28.45 
 
 
383 aa  116  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  28.01 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  30.97 
 
 
386 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  26.56 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  30.48 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  25.93 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  28.99 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  29.71 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  26.94 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  26.29 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  26.23 
 
 
390 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  26.84 
 
 
386 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  30 
 
 
380 aa  109  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  30.17 
 
 
384 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 
374 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  27.5 
 
 
391 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  27.87 
 
 
390 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  27.5 
 
 
391 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  27.5 
 
 
391 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 
391 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  26.23 
 
 
389 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  25.85 
 
 
389 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  25.85 
 
 
389 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  26.76 
 
 
391 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
384 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  25.57 
 
 
389 aa  106  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  26.95 
 
 
389 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  28.41 
 
 
386 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  26.77 
 
 
389 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  26.3 
 
 
385 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  29.53 
 
 
384 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.49 
 
 
384 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  29.19 
 
 
385 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  27.87 
 
 
389 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2005  major facilitator transporter  28.39 
 
 
390 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  27.48 
 
 
399 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
389 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  28.37 
 
 
382 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  30.77 
 
 
365 aa  99.8  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  30.6 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  27.78 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  27.1 
 
 
387 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  29.15 
 
 
383 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  28.08 
 
 
387 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  28.28 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
396 aa  93.2  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1951  major facilitator transporter  31.06 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577429  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
385 aa  89.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>