137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0929 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0929  major facilitator transporter  100 
 
 		 392 aa  702    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382105  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  82.67 
 
 		 374 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1009  major facilitator transporter  55.79 
 
 		 389 aa  278  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0757  major facilitator superfamily MFS_1  55.26 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1321  major facilitator superfamily MFS_1  59.6 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0841  major facilitator transporter  54.21 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00552235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.09 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.82 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  35.99 
 
 		 379 aa  143  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.6 
 
 		 385 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.21 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.44 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.44 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.44 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.44 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.16 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 402 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  34.44 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  34.44 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.44 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.33 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.16 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  35.81 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  35.81 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  35.81 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.49 
 
 		 386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.99 
 
 		 379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.23 
 
 		 393 aa  132  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.99 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  30.93 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  30.92 
 
 		 386 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.29 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.54 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.48 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 406 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  30.03 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2005  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.31 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  29.43 
 
 		 387 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  29.2 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.72 
 
 		 399 aa  89.7  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1588  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  32.18 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  27.95 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0949  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000750812 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4960  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.66 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1951  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577429  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  27.15 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3362  hypothetical protein  28.35 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  26.57 
 
 		 386 aa  67  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  25.98 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0816  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0515849  normal  0.140631 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  22.59 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.12 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0890  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>