126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0841 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0841  major facilitator transporter  100 
 
 		 388 aa  688    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00552235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1009  major facilitator transporter  54.95 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0757  major facilitator superfamily MFS_1  54.95 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  54.78 
 
 		 374 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1321  major facilitator superfamily MFS_1  56 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0929  major facilitator transporter  53.25 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382105  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.33 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.07 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.07 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.81 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.6 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.95 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.04 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  33.68 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.68 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.68 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  32.89 
 
 		 379 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  32.89 
 
 		 379 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.89 
 
 		 379 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.98 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.98 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.98 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.98 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.1 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.42 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.53 
 
 		 379 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.45 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 397 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.42 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.11 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.99 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  32.69 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  35.47 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2005  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.03 
 
 		 396 aa  96.3  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 400 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  28.27 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  24.32 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.86 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  33.04 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  25.62 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  28.72 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4960  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  30.38 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3362  hypothetical protein  29.35 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0890  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1951  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 391 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577429  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  28.53 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0850  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  26.32 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  24.72 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.02 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  27.58 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  27.53 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1588  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  24 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0816  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 410 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0515849  normal  0.140631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>