78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3362 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3362  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  756    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.42 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.17 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.73 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.29 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  27.42 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  25.97 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.68 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  24.42 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.42 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  24.42 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.13 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.13 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.13 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.42 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.42 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  24.42 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.16 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.42 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.13 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.61 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 391 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.48 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  25 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.76 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.91 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  23.81 
 
 		 422 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  24.93 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  24.06 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1009  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  24.17 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  23.35 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 389 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0929  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382105  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0757  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  21.54 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.03 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.93 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  21.72 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0841  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00552235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  20.17 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  27.01 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.42 
 
 		 380 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>