170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0678 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 394 aa  768    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  59.29 
 
 		 392 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1588  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  28.03 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  27.04 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1592  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  24.61 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1718  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  28.53 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  26.9 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  25.41 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  26.6 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  22.56 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  26.88 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  26.82 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  25 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  27.5 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1776  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.56574  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  33.94 
 
 		 957 aa  66.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  24.66 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  26.2 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  23.01 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  24.66 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  25.64 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0665  hypothetical protein  30.34 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  24.4 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  24.4 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  23.72 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  23.72 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  24.4 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  24.4 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  23.72 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  23.72 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  24.4 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  23.72 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  24.13 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  21.6 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  23.33 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  26.28 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  24.13 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  24.65 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  24.03 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  25 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.18 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  19.89 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>