More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0571 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
388 aa  757    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0091  hypothetical protein  46.74 
 
 
277 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  23.94 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  25.13 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  25.14 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  22.22 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  22.85 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.34 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  22 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  21.66 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  23.48 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  23.16 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  22.31 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  32.19 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25.56 
 
 
413 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  23.06 
 
 
425 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  30 
 
 
412 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  23.06 
 
 
425 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  23.06 
 
 
425 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
395 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  25.41 
 
 
461 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  23.06 
 
 
425 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  23.06 
 
 
425 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  23.06 
 
 
425 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  23.06 
 
 
425 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  23.06 
 
 
425 aa  63.5  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 
388 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.56 
 
 
399 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  24.52 
 
 
449 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.67 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  23.06 
 
 
425 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.19 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.27 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  22.48 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  31.54 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.27 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  24.09 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  21.3 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  24.76 
 
 
449 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  22.16 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
451 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  19.76 
 
 
404 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  25.19 
 
 
449 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.33 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  28.35 
 
 
451 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  27.78 
 
 
419 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  19.94 
 
 
388 aa  60.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  19.54 
 
 
957 aa  60.1  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.33 
 
 
381 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  22.69 
 
 
382 aa  60.1  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.33 
 
 
381 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  24.2 
 
 
449 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  23.2 
 
 
415 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  24.2 
 
 
449 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  24.2 
 
 
449 aa  59.7  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  24.2 
 
 
449 aa  59.7  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  24.69 
 
 
449 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  24 
 
 
461 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  22 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.81 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  22 
 
 
417 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.33 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.67 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  24.69 
 
 
449 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.33 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1718  major facilitator transporter  23.41 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  21.12 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0463  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.44223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.33 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.67 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  21.93 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  21.52 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
584 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  22.31 
 
 
409 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  24.22 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  23.48 
 
 
438 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  21.88 
 
 
423 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  32.65 
 
 
419 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  31.63 
 
 
451 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  23.48 
 
 
423 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  23.48 
 
 
423 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.29 
 
 
528 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 
680 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>