94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1836 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  100 
 
 		 411 aa  827    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  56.83 
 
 		 419 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  52.22 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  52.22 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  54.98 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  54.98 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  54.98 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  54.98 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  54.98 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  52.58 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  54.23 
 
 		 418 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  53.96 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  53.96 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  53.96 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  53.96 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  53.96 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  50.72 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  54.23 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  53.96 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  53.96 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  53.71 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  51.73 
 
 		 414 aa  427  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  55.33 
 
 		 418 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  55.33 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  55.33 
 
 		 418 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  55.33 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  47.99 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  54.09 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  54.84 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  54.09 
 
 		 418 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  37.38 
 
 		 400 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  37.05 
 
 		 406 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  38.05 
 
 		 410 aa  276  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  34.9 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  37.82 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  35.19 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  34.45 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  34.1 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  30.9 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  30.9 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  30.9 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  30.9 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  35.28 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  30.9 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  31.19 
 
 		 425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  31.19 
 
 		 425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  30.95 
 
 		 425 aa  212  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  30.95 
 
 		 425 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  30.95 
 
 		 425 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  30.95 
 
 		 425 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  30.95 
 
 		 425 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  30.71 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  35.37 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  30.95 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  34.28 
 
 		 421 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  32.23 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  37.14 
 
 		 419 aa  202  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  32.15 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  33.25 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  32.11 
 
 		 414 aa  190  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  30.5 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  28.76 
 
 		 416 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  25.93 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  24.8 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  21.57 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 391 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 391 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  24.21 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  22.55 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  21.18 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  21.35 
 
 		 387 aa  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  23.93 
 
 		 383 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  22.7 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  24.58 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  25 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  21.25 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  21.47 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>