97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1157 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  100 
 
 		 402 aa  805    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  67.25 
 
 		 400 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  55.16 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  56.57 
 
 		 405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  54.8 
 
 		 406 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  55.09 
 
 		 410 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  47.59 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  48.99 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  47.19 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  40.5 
 
 		 415 aa  318  9e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  41.4 
 
 		 438 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  41.4 
 
 		 438 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  41.26 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  41.26 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  41.26 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  41.26 
 
 		 425 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  41.26 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  41.26 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  41.26 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  41.26 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  41.26 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  41.26 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  41.26 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  41.02 
 
 		 425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  43.38 
 
 		 425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  43.52 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  43.36 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  43.25 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  43.56 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  40.35 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  34.57 
 
 		 411 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 414 aa  242  7e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  32.29 
 
 		 422 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  32.27 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  32.27 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  32.45 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  31.54 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  31.54 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  31.54 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  31.54 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  31.54 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  31.03 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  31.05 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  31.05 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  31.05 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  31.05 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  31.05 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  31.05 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  31.05 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  31.05 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  30.81 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  29.89 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  29.26 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  32.03 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  32.03 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  32.13 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  31.88 
 
 		 418 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  31.88 
 
 		 418 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  31.88 
 
 		 418 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  31.88 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  29.57 
 
 		 459 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  27.79 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  29.1 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  23.95 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  21.68 
 
 		 413 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 385 aa  53.1  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  23.6 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 382 aa  51.2  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 384 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  24.01 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  23.35 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  20.56 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  22.73 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  24.72 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  21.14 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  25.73 
 
 		 957 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>