92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2054 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  100 
 
 		 422 aa  854    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  57.27 
 
 		 458 aa  535  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  61.78 
 
 		 414 aa  538  1e-151  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  53.08 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  51.57 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  51.57 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  50.24 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  51.92 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  51.92 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  51.92 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  52.55 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  51.92 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  51.92 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  50.72 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  52.37 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  52.61 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  52.61 
 
 		 418 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  51.34 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  51.34 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  51.34 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  51.34 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  51.34 
 
 		 418 aa  411  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  51.34 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  52.13 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  52.13 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  52.13 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  51.34 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  51.34 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  51.9 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  51.09 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  36.17 
 
 		 406 aa  272  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  33.96 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  35.44 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  34.68 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  34.18 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  34.02 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  31.49 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  33.9 
 
 		 415 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  33.08 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  31.78 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  33.17 
 
 		 414 aa  209  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  34.7 
 
 		 419 aa  206  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  32.36 
 
 		 414 aa  199  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  29.7 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  29.7 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  29.7 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  29.7 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  29.7 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  29.48 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  29.72 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  29.48 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  29.48 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  29.48 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  29.48 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  29.48 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  29.25 
 
 		 425 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  29.25 
 
 		 425 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  30.42 
 
 		 425 aa  189  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  32.22 
 
 		 421 aa  186  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  30.25 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  25.25 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  26.59 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  27.69 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  24.87 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  22.04 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  20.99 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  20.76 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  22.09 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  23.86 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  21.63 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  23 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  19.64 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  20.54 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  21.86 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  20.67 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  21.86 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  21.86 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  21.58 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  25 
 
 		 380 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  17.15 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>