107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2283 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
402 aa  791    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0543  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
383 aa  158  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  25.78 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  25.57 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  23.71 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  20.99 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  24.23 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  25.99 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.998859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  26.06 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  20.84 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  25 
 
 
438 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  25 
 
 
438 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.85 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  26.06 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  22.52 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  25.42 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  25.42 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  25.42 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  26.27 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0170567 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  25.99 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  25.99 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  25.99 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  25.99 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  25.99 
 
 
425 aa  64.3  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  23 
 
 
389 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  22.53 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  21.16 
 
 
383 aa  61.6  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  20.05 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  22.29 
 
 
402 aa  59.7  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  23.22 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  21.85 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  21.85 
 
 
391 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  22.46 
 
 
402 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  21.94 
 
 
389 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  21.85 
 
 
391 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  21.29 
 
 
389 aa  57  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  21.94 
 
 
389 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  19.69 
 
 
391 aa  56.6  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  21.95 
 
 
386 aa  56.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  21.65 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  20.28 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  20.96 
 
 
386 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  21.53 
 
 
397 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  21.62 
 
 
391 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  21.84 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  22.64 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  19.32 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  22.83 
 
 
397 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  19.58 
 
 
395 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  21.53 
 
 
406 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  21.86 
 
 
451 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  21.07 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  20.16 
 
 
411 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  20.05 
 
 
385 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  20.95 
 
 
379 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  20.95 
 
 
379 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  20.95 
 
 
379 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  20.61 
 
 
451 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  20.95 
 
 
379 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  20.95 
 
 
379 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  21.96 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  19.31 
 
 
439 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.73 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  21.45 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  21.84 
 
 
380 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  19.89 
 
 
389 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  19.42 
 
 
458 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  19.11 
 
 
424 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.7 
 
 
534 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0970  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.72 
 
 
737 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  20.98 
 
 
382 aa  47  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  19.83 
 
 
423 aa  47  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.54 
 
 
495 aa  47  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  20.97 
 
 
380 aa  47  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  20.67 
 
 
420 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  20.46 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  20.88 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  22.47 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  27.08 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  22.96 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  21.76 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  25.33 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  20.79 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 
578 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
491 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  20.41 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  20 
 
 
379 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  20 
 
 
379 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  30.17 
 
 
397 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  19.77 
 
 
404 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  21.2 
 
 
415 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  20.6 
 
 
405 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  21.18 
 
 
584 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
397 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
397 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.25 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>