More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_880 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  100 
 
 		 423 aa  839    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  91.65 
 
 		 395 aa  733    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  29.17 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  27.37 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  27.79 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  27.79 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  27.79 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  27.79 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  30.19 
 
 		 407 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.05 
 
 		 423 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  26.77 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  26.92 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  29.18 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  28.49 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  28.61 
 
 		 395 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  28.9 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  28.9 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  28.9 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  28.21 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 405 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2918  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  27.32 
 
 		 432 aa  106  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  27.2 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  27.61 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  27.32 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  27.32 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  27.32 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  27.66 
 
 		 413 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  27.39 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  27.93 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  25.29 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  26.18 
 
 		 417 aa  98.2  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 392 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 393 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  27.3 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 410 aa  97.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 392 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 404 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  24.29 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 397 aa  94  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  26.86 
 
 		 412 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  27.52 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 407 aa  93.2  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  24.44 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.87 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  24.73 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.33 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.6 
 
 		 397 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.6 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.6 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.6 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.06 
 
 		 397 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.06 
 
 		 397 aa  90.1  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 433 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0417  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.117512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 397 aa  87.8  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 416 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  24.11 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  24.11 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  24.66 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  25.67 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  25.65 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>