125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4910 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  100 
 
 		 424 aa  827    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  65.52 
 
 		 411 aa  463  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  62.98 
 
 		 424 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  62.56 
 
 		 425 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  57.88 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  57.63 
 
 		 417 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  61.9 
 
 		 420 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  59.01 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  54.78 
 
 		 439 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  63.61 
 
 		 421 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  56.06 
 
 		 439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  57.46 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  55.82 
 
 		 439 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  62.2 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  57.39 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  54.34 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  53.03 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  48.54 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 451 aa  289  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 		 451 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 		 453 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 		 436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  44.41 
 
 		 407 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 		 420 aa  249  8e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 		 428 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 446 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 416 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 421 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 421 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 426 aa  235  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 426 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  36.61 
 
 		 439 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  36.67 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 419 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 420 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 438 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  35.24 
 
 		 420 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 428 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 417 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 419 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  35.12 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  38.98 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  28.08 
 
 		 473 aa  149  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  34.44 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  27.64 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  20.52 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  18.73 
 
 		 402 aa  57  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 457 aa  53.5  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.08 
 
 		 478 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.08 
 
 		 484 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  29.41 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.95 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  28.97 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.56 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 498 aa  46.6  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.26 
 
 		 592 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  27.08 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>