196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3356 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  79.95 
 
 		 417 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  78.82 
 
 		 432 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  825    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  61.9 
 
 		 424 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  62.19 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  64.39 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  62.18 
 
 		 411 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  59.14 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  59.14 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  57 
 
 		 439 aa  435  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  62.31 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  61.27 
 
 		 442 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  57.57 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  59.55 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  57.14 
 
 		 418 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  66.07 
 
 		 421 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  63.76 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 423 aa  355  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 451 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 		 451 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  45.12 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  43 
 
 		 446 aa  269  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 426 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 403 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  39.13 
 
 		 439 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 426 aa  245  9e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 433 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  42.2 
 
 		 407 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 410 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  35.95 
 
 		 431 aa  226  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 420 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 449 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  35.79 
 
 		 420 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 419 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 428 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  34.83 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  37.22 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  31.32 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  33.62 
 
 		 372 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  20.1 
 
 		 402 aa  57  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.72 
 
 		 592 aa  54.3  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 476 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 452 aa  53.1  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.71 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 486 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.43 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 491 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.67 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.2 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  20.11 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  29.32 
 
 		 510 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  23.08 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  27.89 
 
 		 548 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 489 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.62 
 
 		 386 aa  50.8  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.99 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 495 aa  50.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.26 
 
 		 405 aa  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  27.74 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 531 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.92 
 
 		 549 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  24.34 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  24.15 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.28 
 
 		 549 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.81 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  26.28 
 
 		 549 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>