116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1628 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  829    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  72.5 
 
 		 439 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  72.9 
 
 		 434 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  71.18 
 
 		 439 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  70.69 
 
 		 439 aa  532  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  69.14 
 
 		 442 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  72.5 
 
 		 438 aa  521  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  62.13 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  61.46 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  58.15 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  57 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  59.7 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  57.57 
 
 		 420 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  54.34 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  63.18 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  51.64 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  60.15 
 
 		 419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 423 aa  325  6e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  41.2 
 
 		 439 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 451 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 451 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 416 aa  256  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 426 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 		 436 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 446 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  39.65 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 451 aa  226  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 386 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  41.37 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  39.55 
 
 		 421 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 426 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 417 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 417 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  34.78 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 438 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 417 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 419 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  33 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 419 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 428 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  33.92 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 419 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 419 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 419 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  34.09 
 
 		 415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  33.52 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  34.48 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  27.99 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.06 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 462 aa  53.1  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  24.42 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  22.63 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.76 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  24.42 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  23.76 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.76 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  24.09 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  26.81 
 
 		 454 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  26.81 
 
 		 454 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  23.76 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  26.81 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  22.71 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  26.81 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  22.9 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  26.98 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 460 aa  47  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  26.54 
 
 		 454 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  24.8 
 
 		 485 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  24.8 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.74 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  24.8 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  24.8 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  25.26 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>