108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3213 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  822    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  73.33 
 
 		 439 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  73.65 
 
 		 416 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  81.58 
 
 		 386 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  55.09 
 
 		 451 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  57.84 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  54.86 
 
 		 451 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  55.4 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  53.86 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  54.98 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  52.84 
 
 		 419 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  53.25 
 
 		 419 aa  348  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  52.85 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  53.06 
 
 		 417 aa  346  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  52.69 
 
 		 417 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 419 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 419 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 419 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  52.81 
 
 		 419 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  52.14 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  51.63 
 
 		 420 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  52.74 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  52.93 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  52.93 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  52.93 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  52.93 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  52.13 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  50.7 
 
 		 372 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  39.5 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 442 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  37.78 
 
 		 418 aa  233  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 420 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 439 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 439 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 424 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 438 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 419 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 403 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 421 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 421 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 421 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  36.04 
 
 		 407 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  29.68 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  33.58 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 449 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  23.57 
 
 		 473 aa  92.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.52 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.24 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.24 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.24 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.38 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.38 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.24 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  23.97 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  24.24 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  27.08 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 425 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 408 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  27.81 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 494 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  27.11 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 503 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>