More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3215 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
494 aa  953    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  51.42 
 
 
523 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  52.85 
 
 
492 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  53.25 
 
 
457 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  48.76 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  53.76 
 
 
482 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  47.35 
 
 
643 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  47.35 
 
 
643 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  47.35 
 
 
643 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  50 
 
 
517 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  50.23 
 
 
487 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 
512 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 
499 aa  362  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 
503 aa  351  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  47.55 
 
 
504 aa  350  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 
678 aa  345  8e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  39.34 
 
 
485 aa  336  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  42.74 
 
 
492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  44.54 
 
 
650 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  42.95 
 
 
494 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
480 aa  301  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  39.22 
 
 
476 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 
491 aa  243  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 
485 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  34.47 
 
 
488 aa  229  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 
487 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 
498 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
474 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
484 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  34.27 
 
 
487 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  33.76 
 
 
487 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  33.76 
 
 
487 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 
482 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  29.33 
 
 
477 aa  190  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 
449 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  29.75 
 
 
471 aa  190  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
472 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  33.26 
 
 
479 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  32.89 
 
 
477 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  33.76 
 
 
489 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  33.84 
 
 
548 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 
484 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.473826 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
472 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  32.34 
 
 
500 aa  177  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  27.08 
 
 
477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  30.29 
 
 
473 aa  172  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
475 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  30.89 
 
 
491 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
463 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 
474 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.91 
 
 
592 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  33.11 
 
 
483 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  27.33 
 
 
473 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
487 aa  153  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  25 
 
 
470 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  27.19 
 
 
502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.21 
 
 
510 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 
532 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.36 
 
 
534 aa  130  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.23 
 
 
522 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.91 
 
 
697 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 
528 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  25.23 
 
 
464 aa  126  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  23.42 
 
 
507 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 
478 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 
478 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.08 
 
 
469 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0115  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
554 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434385  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  22.63 
 
 
507 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 
477 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.82 
 
 
478 aa  123  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  27.82 
 
 
478 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 
476 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 
478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.56 
 
 
478 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.3 
 
 
479 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.18 
 
 
482 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.3 
 
 
479 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 
526 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.14 
 
 
676 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.26 
 
 
513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  23.39 
 
 
513 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.39 
 
 
513 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.51 
 
 
539 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.26 
 
 
513 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  23.39 
 
 
513 aa  120  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.39 
 
 
513 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.39 
 
 
513 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
448 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.39 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.39 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.35 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.7 
 
 
534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  27.76 
 
 
534 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.14 
 
 
513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.13 
 
 
541 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.14 
 
 
511 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>