More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1295 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  100 
 
 		 500 aa  950    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  51.28 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 678 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  33.4 
 
 		 485 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 494 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 491 aa  223  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 499 aa  218  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 		 474 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 457 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 488 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 650 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 523 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 474 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 484 aa  199  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 503 aa  199  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 643 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  33.91 
 
 		 643 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 643 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 517 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 487 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 512 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  32.64 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  33.91 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 477 aa  176  7e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 504 aa  173  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  31.42 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 464 aa  171  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.68 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 473 aa  167  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 480 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  31.76 
 
 		 487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 471 aa  160  6e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 498 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 502 aa  156  9e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 548 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  29.74 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 479 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 		 523 aa  140  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 487 aa  140  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.75 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.23 
 
 		 685 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 491 aa  137  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 487 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  33.84 
 
 		 487 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 487 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.3 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.45 
 
 		 478 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  28.12 
 
 		 508 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.45 
 
 		 478 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 		 641 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.45 
 
 		 478 aa  134  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 528 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.45 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  27.45 
 
 		 478 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.45 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.45 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  26.29 
 
 		 507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.97 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.45 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.49 
 
 		 525 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 504 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  28.65 
 
 		 1062 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.27 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  26.57 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.39 
 
 		 537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.79 
 
 		 489 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.48 
 
 		 504 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  30.73 
 
 		 501 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.13 
 
 		 521 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.53 
 
 		 511 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.83 
 
 		 538 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.41 
 
 		 539 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  25.31 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  29.41 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.14 
 
 		 569 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.13 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 		 682 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 		 682 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 		 682 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.64 
 
 		 480 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 		 528 aa  123  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.98 
 
 		 592 aa  123  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.13 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.13 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>