More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0898 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  100 
 
 		 464 aa  894    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  30.08 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 491 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 678 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 523 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 457 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  31.13 
 
 		 500 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 499 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 503 aa  134  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  29.44 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 643 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  28.37 
 
 		 643 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 643 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 480 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 650 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.37 
 
 		 528 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  26.97 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.46 
 
 		 480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  29.85 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  22.32 
 
 		 487 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.31 
 
 		 479 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.31 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  28.93 
 
 		 511 aa  114  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 474 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 504 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 492 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 512 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.31 
 
 		 478 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  25.31 
 
 		 478 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.06 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25.06 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 498 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.06 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.06 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.3 
 
 		 514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.46 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.26 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1374  multidrug resistance protein B  24.13 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.394355  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  27.74 
 
 		 476 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.5 
 
 		 534 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1434  MFS family transporter  24.13 
 
 		 452 aa  106  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 496 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.79 
 
 		 565 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 		 501 aa  104  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.18 
 
 		 478 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 503 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.48 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.05 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  25.72 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.38 
 
 		 522 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.25 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.17 
 
 		 521 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 		 516 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.58 
 
 		 522 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  27.69 
 
 		 530 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 517 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.74 
 
 		 570 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.74 
 
 		 517 aa  100  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.19 
 
 		 485 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.85 
 
 		 456 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.67 
 
 		 517 aa  99.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 479 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.33 
 
 		 511 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 		 512 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.07 
 
 		 521 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 472 aa  97.8  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.46 
 
 		 526 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 548 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.2 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  24.03 
 
 		 534 aa  97.4  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.94 
 
 		 478 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.42 
 
 		 539 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.02 
 
 		 541 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.94 
 
 		 484 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  27.06 
 
 		 576 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 491 aa  97.4  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>