More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1789 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 512 aa  967    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  69.39 
 
 		 492 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  69.76 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  65.91 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  57.35 
 
 		 523 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  53.14 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  56.99 
 
 		 487 aa  445  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  53.39 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  52.95 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  53.75 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  49.79 
 
 		 643 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  49.79 
 
 		 643 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  49.37 
 
 		 643 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  50.43 
 
 		 503 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  44.72 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  49.47 
 
 		 678 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  49.46 
 
 		 650 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  49.58 
 
 		 494 aa  352  8e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  47.6 
 
 		 492 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 		 480 aa  332  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 491 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  42.5 
 
 		 476 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 		 484 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 487 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 488 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 		 498 aa  223  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 487 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  39.51 
 
 		 487 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 487 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 485 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  39.48 
 
 		 489 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 472 aa  209  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 		 482 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.39 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 548 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 484 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  33.83 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 472 aa  187  5e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 474 aa  183  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 473 aa  160  7e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 463 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  32.85 
 
 		 500 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.47 
 
 		 592 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 579 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.15 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 		 474 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.83 
 
 		 593 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.04 
 
 		 477 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.61 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.08 
 
 		 555 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.68 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.23 
 
 		 521 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 		 607 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.12 
 
 		 538 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.11 
 
 		 525 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.23 
 
 		 539 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.06 
 
 		 685 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.89 
 
 		 569 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 		 537 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.42 
 
 		 554 aa  133  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  31.95 
 
 		 483 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  24.81 
 
 		 507 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.33 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  27.67 
 
 		 561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.02 
 
 		 517 aa  131  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.11 
 
 		 504 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 548 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  24.3 
 
 		 507 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.11 
 
 		 635 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.27 
 
 		 529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.38 
 
 		 541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 		 539 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.38 
 
 		 513 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.61 
 
 		 513 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.38 
 
 		 513 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 471 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 		 536 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  28.53 
 
 		 511 aa  126  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.87 
 
 		 513 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  22.87 
 
 		 513 aa  126  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.87 
 
 		 513 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.87 
 
 		 513 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.19 
 
 		 666 aa  126  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.11 
 
 		 515 aa  126  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>