More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5903 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 487 aa  924    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  38.91 
 
 		 488 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 494 aa  290  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  38.91 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 		 678 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  39.9 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 457 aa  267  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 482 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 		 499 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 523 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  39.91 
 
 		 476 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 491 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  33.12 
 
 		 485 aa  252  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 650 aa  250  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 484 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  42.43 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 487 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 517 aa  240  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 474 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 506 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 503 aa  237  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  38.22 
 
 		 487 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 504 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  36.4 
 
 		 643 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  36.4 
 
 		 643 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  36.4 
 
 		 643 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 512 aa  229  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 482 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  39.64 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.29 
 
 		 449 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 480 aa  209  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  38 
 
 		 479 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 498 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 494 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 474 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  34.75 
 
 		 500 aa  187  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 548 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 477 aa  179  9e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  36.39 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  31.02 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 472 aa  170  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 477 aa  170  6e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 463 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 471 aa  162  9e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.33 
 
 		 592 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 475 aa  160  7e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 569 aa  151  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 502 aa  149  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.64 
 
 		 682 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.64 
 
 		 682 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.64 
 
 		 682 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.01 
 
 		 522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.18 
 
 		 488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.4 
 
 		 666 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.96 
 
 		 697 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.87 
 
 		 520 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.11 
 
 		 534 aa  144  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 		 850 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 523 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.97 
 
 		 678 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0115  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 554 aa  140  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 		 528 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  27.86 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.08 
 
 		 676 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.51 
 
 		 522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 		 522 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 491 aa  136  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 		 558 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.28 
 
 		 541 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.77 
 
 		 528 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.51 
 
 		 593 aa  133  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.6 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 		 528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.24 
 
 		 650 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.33 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 		 554 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.51 
 
 		 482 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.76 
 
 		 680 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 		 530 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.89 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 494 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 		 522 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.89 
 
 		 478 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.14 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.89 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2674  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.45 
 
 		 684 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.78 
 
 		 480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.22 
 
 		 672 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.62 
 
 		 491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>