More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7073 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  100 
 
 		 492 aa  928    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  75.41 
 
 		 482 aa  581  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  73.25 
 
 		 457 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  69.96 
 
 		 512 aa  552  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  60 
 
 		 523 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  56.89 
 
 		 506 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  62.06 
 
 		 517 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  60.76 
 
 		 487 aa  466  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  52.85 
 
 		 494 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  52.01 
 
 		 499 aa  435  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  58.13 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  52.03 
 
 		 643 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  52.03 
 
 		 643 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  52.03 
 
 		 643 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 678 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  48.93 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  48 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  52.13 
 
 		 650 aa  375  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  43.83 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  51.57 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  47.9 
 
 		 480 aa  353  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  42.83 
 
 		 476 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  40.17 
 
 		 491 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  43.03 
 
 		 484 aa  263  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 		 485 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  35.7 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  38.63 
 
 		 498 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.28 
 
 		 449 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 477 aa  211  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 548 aa  203  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 		 482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 487 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  36.06 
 
 		 487 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 487 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 479 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  35.18 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 473 aa  186  9e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 		 484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 477 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 463 aa  173  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  33.91 
 
 		 500 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 502 aa  160  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 487 aa  153  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.06 
 
 		 592 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29 
 
 		 534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 470 aa  146  9e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.52 
 
 		 579 aa  143  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.25 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 522 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 534 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 569 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 		 530 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 		 530 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 		 530 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 		 530 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  32.73 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.79 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.57 
 
 		 678 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 685 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.95 
 
 		 539 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 448 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 		 514 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.38 
 
 		 526 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.21 
 
 		 525 aa  133  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  27.38 
 
 		 561 aa  133  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 		 535 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.13 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.26 
 
 		 538 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.4 
 
 		 528 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.01 
 
 		 528 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 		 666 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  28.36 
 
 		 511 aa  129  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.83 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.72 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.35 
 
 		 685 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 		 474 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.87 
 
 		 506 aa  128  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.69 
 
 		 520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 		 524 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.88 
 
 		 593 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 532 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.16 
 
 		 571 aa  127  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.59 
 
 		 478 aa  126  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.2 
 
 		 534 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 		 650 aa  126  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>