More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4580 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 473 aa  888    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  56.79 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 548 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 498 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 494 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  29.48 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 678 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 523 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 506 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  33.1 
 
 		 492 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  32.81 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 491 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.99 
 
 		 449 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 492 aa  126  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 512 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 480 aa  117  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  30.33 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  29.6 
 
 		 643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 487 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  31.61 
 
 		 487 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  31.84 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 474 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 491 aa  103  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 494 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 475 aa  99.8  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 470 aa  97.1  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 477 aa  95.9  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 474 aa  90.5  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  27.38 
 
 		 500 aa  90.5  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.11 
 
 		 539 aa  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  36 
 
 		 650 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  32.37 
 
 		 476 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 464 aa  87  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.22 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.76 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.13 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  21.45 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  32.55 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.11 
 
 		 504 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.51 
 
 		 488 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.51 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.41 
 
 		 593 aa  77  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.02 
 
 		 522 aa  76.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.11 
 
 		 528 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.87 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.88 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.76 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  22.62 
 
 		 561 aa  73.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.3 
 
 		 523 aa  73.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.95 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  19.47 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  25.38 
 
 		 571 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.95 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.59 
 
 		 575 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.28 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  21.73 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.6 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.2 
 
 		 524 aa  71.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.39 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.5 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.77 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.26 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.38 
 
 		 498 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.81 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  21.73 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.26 
 
 		 536 aa  70.5  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.26 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.18 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.26 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.6 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.26 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>