More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2371 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 472 aa  854    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  45.39 
 
 		 463 aa  297  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  48.34 
 
 		 498 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  45.77 
 
 		 548 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  44.05 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 		 678 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 494 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  39.77 
 
 		 492 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 482 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 499 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 512 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  34.04 
 
 		 485 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 523 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 492 aa  196  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 643 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  36.43 
 
 		 643 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 643 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 		 494 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  35.96 
 
 		 487 aa  182  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 503 aa  180  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 491 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 517 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  34.16 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 485 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 474 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 650 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.32 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  35.5 
 
 		 489 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 482 aa  156  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 474 aa  146  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  34.9 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  34.11 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 487 aa  127  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  32.46 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  34.64 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 478 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 491 aa  113  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 478 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.05 
 
 		 697 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 475 aa  103  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.58 
 
 		 607 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.76 
 
 		 592 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 479 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.93 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 473 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4865  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 477 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 		 480 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.3 
 
 		 534 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 		 528 aa  99  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.65 
 
 		 539 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 		 502 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1266  MFS family transporter  32.57 
 
 		 476 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3033  major facilitator family transporter  32.57 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.24 
 
 		 500 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 471 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 		 532 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.71 
 
 		 508 aa  97.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 470 aa  97.1  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 534 aa  97.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.9 
 
 		 535 aa  97.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 		 523 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 		 682 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 		 682 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 		 682 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.36 
 
 		 514 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 514 aa  93.2  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 528 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.17 
 
 		 515 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.6 
 
 		 506 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.18 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.18 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.18 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.18 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.18 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.18 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.88 
 
 		 558 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 569 aa  91.3  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.12 
 
 		 515 aa  90.9  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 		 503 aa  90.5  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 		 504 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.39 
 
 		 515 aa  90.1  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>