More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3018 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 474 aa  879    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 485 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  39.7 
 
 		 491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  34.28 
 
 		 485 aa  226  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 494 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 678 aa  219  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 523 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  34.16 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 484 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 506 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 482 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 484 aa  203  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 449 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 482 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  33.41 
 
 		 477 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 650 aa  193  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  36.11 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  36.98 
 
 		 500 aa  190  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 504 aa  189  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 499 aa  187  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 		 487 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 503 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 494 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  31.28 
 
 		 643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  37.75 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 548 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 498 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 480 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  30 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  34.88 
 
 		 487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 471 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  34.25 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 487 aa  157  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 487 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  35.2 
 
 		 487 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 487 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 477 aa  153  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 491 aa  150  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.89 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 		 592 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.04 
 
 		 506 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 		 697 aa  141  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 473 aa  140  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.74 
 
 		 469 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  29.74 
 
 		 478 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.49 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  29.49 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.08 
 
 		 569 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.39 
 
 		 431 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.97 
 
 		 489 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.71 
 
 		 539 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 511 aa  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.74 
 
 		 511 aa  133  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.62 
 
 		 593 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  25.25 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.65 
 
 		 565 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.61 
 
 		 528 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.97 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  25.74 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  29.55 
 
 		 508 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 		 511 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 		 511 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.82 
 
 		 478 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 460 aa  130  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.43 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.37 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.3 
 
 		 682 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  30.74 
 
 		 492 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  26.08 
 
 		 490 aa  126  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0320  transporter, major facilitator family protein  27.72 
 
 		 474 aa  126  8.000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>