More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4203 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  100 
 
 		 506 aa  969    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  54.79 
 
 		 523 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  57.98 
 
 		 492 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  58.06 
 
 		 457 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  55.7 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  53.14 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  51.46 
 
 		 643 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  51.46 
 
 		 643 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  51.46 
 
 		 643 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  53.86 
 
 		 487 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  52.22 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  48.91 
 
 		 503 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  53.96 
 
 		 482 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  50.47 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 678 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  43.93 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  44.97 
 
 		 492 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 		 494 aa  352  7e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 650 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 		 491 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  38.89 
 
 		 476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 		 484 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 485 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  35.12 
 
 		 489 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 487 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 474 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  35.02 
 
 		 498 aa  203  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 477 aa  202  9e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 		 482 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  35.47 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  33.04 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 487 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 449 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 472 aa  180  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 471 aa  173  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 463 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 474 aa  169  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  37.09 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 491 aa  161  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.6 
 
 		 521 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 464 aa  149  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 509 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 		 517 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.36 
 
 		 531 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.86 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  32.62 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.35 
 
 		 524 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.1 
 
 		 512 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.07 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 511 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.76 
 
 		 519 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.17 
 
 		 529 aa  136  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 518 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.61 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.01 
 
 		 515 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.05 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.23 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.37 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.8 
 
 		 525 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.34 
 
 		 528 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 		 528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.37 
 
 		 511 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 		 532 aa  134  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.13 
 
 		 577 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 517 aa  133  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.42 
 
 		 537 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.1 
 
 		 524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.82 
 
 		 519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2369  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.82 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.16 
 
 		 512 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.88 
 
 		 543 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.38 
 
 		 532 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 		 512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2467  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.67 
 
 		 508 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  23.7 
 
 		 534 aa  130  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.35 
 
 		 520 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.78 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.35 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.96 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.78 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.31 
 
 		 523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.35 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>