More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5354 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 449 aa  827    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  45.78 
 
 		 476 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  38.46 
 
 		 485 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 488 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  39.04 
 
 		 492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 678 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 457 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 523 aa  202  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 		 482 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 506 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 643 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  37.44 
 
 		 643 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 643 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 		 512 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 		 484 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 485 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 		 474 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 487 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 650 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 		 482 aa  173  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  36.19 
 
 		 487 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 517 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 498 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  34.74 
 
 		 489 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 479 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 487 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.57 
 
 		 522 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  36.06 
 
 		 487 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 494 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 548 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 474 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  35.75 
 
 		 500 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  28.97 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 475 aa  133  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.51 
 
 		 592 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 		 488 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 502 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.96 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.46 
 
 		 504 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  29.61 
 
 		 530 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.5 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.52 
 
 		 579 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 		 489 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6604  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 515 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 528 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.61 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.06 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.49 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.02 
 
 		 666 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.46 
 
 		 514 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.23 
 
 		 535 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.39 
 
 		 569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.26 
 
 		 493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 		 528 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.81 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.53 
 
 		 489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  34.02 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0503  major facilitator superfamily permease  27.95 
 
 		 568 aa  111  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.737729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.25 
 
 		 539 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.95 
 
 		 504 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2125  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 507 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2928  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.19 
 
 		 534 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.48 
 
 		 676 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  27.23 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.09 
 
 		 641 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.93 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.32 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.22 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.55 
 
 		 607 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 		 480 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.43 
 
 		 539 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 		 522 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 		 565 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.04 
 
 		 522 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>