More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1235 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
491 aa  932    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  41.42 
 
 
488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 
474 aa  307  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 
678 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  38.99 
 
 
523 aa  292  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  37.32 
 
 
485 aa  289  8e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 
485 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  41.67 
 
 
457 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  38.56 
 
 
506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 
499 aa  283  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 
494 aa  279  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  40.47 
 
 
492 aa  273  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  40.44 
 
 
517 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  40 
 
 
476 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 
503 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
512 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  41.2 
 
 
484 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  39.5 
 
 
487 aa  266  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 
482 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 
487 aa  264  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 
492 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  37.96 
 
 
650 aa  249  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  39.33 
 
 
504 aa  248  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  36.14 
 
 
643 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  36.14 
 
 
643 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  36.14 
 
 
643 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  39.7 
 
 
474 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  31.53 
 
 
477 aa  231  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 
494 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 
482 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  38 
 
 
483 aa  227  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 
484 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  36.01 
 
 
500 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
480 aa  216  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  37.72 
 
 
489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  37.93 
 
 
548 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  37 
 
 
479 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  32.29 
 
 
491 aa  206  8e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  31.05 
 
 
471 aa  204  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 
498 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  38.64 
 
 
487 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  38.64 
 
 
487 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  38.89 
 
 
487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  29.13 
 
 
502 aa  198  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.61 
 
 
449 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  30.94 
 
 
464 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
475 aa  193  7e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  29.46 
 
 
473 aa  192  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  30.67 
 
 
473 aa  190  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.58 
 
 
515 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.08 
 
 
515 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
521 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  32.47 
 
 
477 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
472 aa  186  8e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  31.57 
 
 
477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 
555 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.37 
 
 
522 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.05 
 
 
524 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 
522 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 
682 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 
682 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 
682 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 
513 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  28.99 
 
 
513 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  28.99 
 
 
513 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 
513 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.99 
 
 
513 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.23 
 
 
513 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.99 
 
 
513 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.92 
 
 
528 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.7 
 
 
520 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 
513 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.24 
 
 
569 aa  177  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.78 
 
 
513 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 
513 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  33.74 
 
 
515 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.89 
 
 
530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.59 
 
 
685 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 
502 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  28.57 
 
 
507 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.32 
 
 
537 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31 
 
 
517 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 
528 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.75 
 
 
511 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 
517 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.24 
 
 
511 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
488 aa  171  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.41 
 
 
522 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.48 
 
 
511 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.48 
 
 
511 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 
474 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 
519 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 
534 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.48 
 
 
511 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.7 
 
 
697 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 
531 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  27.51 
 
 
507 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  29.48 
 
 
511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.24 
 
 
511 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>