More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2569 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  100 
 
 		 487 aa  922    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 487 aa  922    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  99.18 
 
 		 487 aa  917    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  75.16 
 
 		 479 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  74 
 
 		 489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  48.57 
 
 		 482 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 457 aa  253  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 523 aa  249  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 503 aa  249  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 487 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 678 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  39.34 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 494 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 506 aa  240  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 512 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 482 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  34.61 
 
 		 485 aa  226  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  37.64 
 
 		 487 aa  221  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 		 484 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  35.7 
 
 		 492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 494 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 474 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 650 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 643 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  35.49 
 
 		 643 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 643 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.81 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 492 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 		 498 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 548 aa  163  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 472 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  31.32 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 477 aa  149  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  29 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  31.85 
 
 		 500 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 		 487 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  31.05 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 537 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 515 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 470 aa  120  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 502 aa  120  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.04 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.97 
 
 		 593 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 		 850 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 		 534 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0115  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0186  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.02 
 
 		 575 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.67 
 
 		 592 aa  110  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.8 
 
 		 685 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.05 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.14 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.35 
 
 		 650 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 474 aa  107  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  28.57 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  27.22 
 
 		 511 aa  107  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.11 
 
 		 476 aa  107  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.17 
 
 		 680 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.1 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0082  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.46 
 
 		 513 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.7 
 
 		 641 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.12 
 
 		 504 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.46 
 
 		 513 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.66 
 
 		 517 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.61 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.51 
 
 		 569 aa  104  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.52 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.23 
 
 		 685 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.22 
 
 		 513 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  23.22 
 
 		 513 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  23.22 
 
 		 513 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.22 
 
 		 513 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  23.04 
 
 		 507 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.22 
 
 		 513 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  30.04 
 
 		 535 aa  103  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.66 
 
 		 513 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.9 
 
 		 513 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.91 
 
 		 504 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.19 
 
 		 504 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0320  transporter, major facilitator family protein  28.21 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>