More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0082 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0186  major facilitator superfamily MFS_1  89.63 
 
 		 475 aa  784    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0082  major facilitator transporter  100 
 
 		 474 aa  914    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0320  transporter, major facilitator family protein  50.22 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04410  arabinose efflux permease family protein  53.4 
 
 		 472 aa  425  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.684912 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1748  major facilitator superfamily permease  49.46 
 
 		 476 aa  398  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000637074  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 473 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  28.33 
 
 		 489 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 488 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 491 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.31 
 
 		 511 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  27.07 
 
 		 500 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 525 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 484 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  28.15 
 
 		 534 aa  87.8  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  30 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  28.96 
 
 		 507 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.66 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.41 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  28.57 
 
 		 507 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.63 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.33 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.27 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.09 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.09 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.12 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.45 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  23.12 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  23.12 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.45 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.22 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.1 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.31 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  27.13 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 678 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.48 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 569 aa  80.5  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.18 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 511 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.18 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5607  drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  31.17 
 
 		 475 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864613  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  27.06 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 514 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.18 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  28.22 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  28.09 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.38 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.09 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.76 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.52 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.72 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.24 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44044  suppressor of gal11 null  28.77 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.333138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  32.02 
 
 		 465 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.42 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_0864  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  26.87 
 
 		 511 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.26 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.67 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.99 
 
 		 541 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  29.76 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
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NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  27 
 
 		 529 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
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NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
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NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.55 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263412 
 
 
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NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.72 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.72 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.83 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 643 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
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NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  27.22 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 		 511 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.19 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.51 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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