More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2303 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 463 aa  869    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  55.68 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 548 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 494 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  35.42 
 
 		 492 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 488 aa  163  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 523 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  33 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 678 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  33.11 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 517 aa  156  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  30.83 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 504 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 491 aa  140  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 512 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 487 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 650 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 484 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 484 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  31.28 
 
 		 477 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 643 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  28.76 
 
 		 643 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 643 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 449 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 491 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 482 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  29.77 
 
 		 476 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  25 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  23 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 494 aa  110  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 474 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 479 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  21.08 
 
 		 474 aa  93.2  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  29.4 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  29 
 
 		 489 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 487 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.07 
 
 		 522 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 477 aa  86.7  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.4 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.19 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.31 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  28.9 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  26.97 
 
 		 535 aa  76.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.14 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.08 
 
 		 592 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.48 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.93 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.7 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 607 aa  73.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.12 
 
 		 539 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.3 
 
 		 504 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  21.77 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.7 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.17 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.65 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.21 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  24.21 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.21 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.51 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.43 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.97 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.22 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.97 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  23.73 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.51 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  28.44 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.78 
 
 		 607 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.97 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  24.76 
 
 		 523 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.97 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  25.65 
 
 		 571 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.68 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>