More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2255 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 480 aa  918    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  61.11 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  50 
 
 		 457 aa  356  5.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 523 aa  349  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  47.98 
 
 		 492 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  44.98 
 
 		 506 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 		 499 aa  332  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 		 494 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 517 aa  326  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  46.58 
 
 		 512 aa  325  9e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  46.61 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 643 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 643 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  45.24 
 
 		 643 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  48.54 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 		 678 aa  315  9e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 		 503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  47.59 
 
 		 504 aa  309  8e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  39.61 
 
 		 485 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  41.12 
 
 		 494 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 650 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 491 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 		 498 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  35.31 
 
 		 476 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 488 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 487 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 449 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  33.83 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 485 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 487 aa  163  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 479 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 487 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  32.75 
 
 		 487 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 502 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 491 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 475 aa  148  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  28.03 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 473 aa  139  7.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  33.33 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.51 
 
 		 524 aa  126  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  31.84 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.47 
 
 		 534 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.34 
 
 		 522 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 478 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 478 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.02 
 
 		 592 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.9 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.7 
 
 		 514 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.84 
 
 		 475 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.44 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.44 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.33 
 
 		 478 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0464  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.81 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.79 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.81 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.79 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.81 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.79 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.04 
 
 		 504 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.01 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  26.65 
 
 		 508 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.51 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 496 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 		 527 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  29.29 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.31 
 
 		 528 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.04 
 
 		 558 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  24.82 
 
 		 490 aa  100  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0115  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 554 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 478 aa  99.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.19 
 
 		 570 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.43 
 
 		 534 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 494 aa  97.1  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>