More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0115 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0115  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 554 aa  1088    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 678 aa  148  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 494 aa  145  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 499 aa  144  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 491 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 506 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 523 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 504 aa  123  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  25.58 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 488 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 517 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  27.23 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  29.26 
 
 		 476 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 474 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 457 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 485 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  26.26 
 
 		 487 aa  113  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 484 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4687  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 479 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 487 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 491 aa  110  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 477 aa  108  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 494 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 482 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.07 
 
 		 666 aa  104  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 484 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  26.28 
 
 		 489 aa  103  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 474 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 569 aa  103  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 643 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  26.27 
 
 		 643 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.64 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 643 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.5 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 685 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.5 
 
 		 478 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.45 
 
 		 449 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.74 
 
 		 526 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 473 aa  99.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.74 
 
 		 526 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.08 
 
 		 592 aa  99.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.56 
 
 		 519 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.68 
 
 		 476 aa  96.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  24.95 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 682 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 682 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 682 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.95 
 
 		 493 aa  95.1  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 512 aa  95.1  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 502 aa  94.7  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.87 
 
 		 528 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 		 534 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.96 
 
 		 511 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  29.41 
 
 		 511 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 650 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.14 
 
 		 535 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 		 496 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  28.96 
 
 		 511 aa  92  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.86 
 
 		 478 aa  92  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.21 
 
 		 478 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.86 
 
 		 478 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  27.5 
 
 		 478 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.86 
 
 		 478 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.63 
 
 		 522 aa  91.7  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  29.87 
 
 		 535 aa  90.9  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 650 aa  90.5  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.74 
 
 		 469 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 516 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.14 
 
 		 539 aa  90.1  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 		 511 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.45 
 
 		 535 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 		 511 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  26.64 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02985  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08530)  28.66 
 
 		 626 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.14 
 
 		 479 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.99 
 
 		 524 aa  89.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  27.59 
 
 		 483 aa  89.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 		 504 aa  89.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.79 
 
 		 479 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.5 
 
 		 615 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 676 aa  88.6  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.42 
 
 		 567 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.11 
 
 		 480 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05301  integral membrane transmembrane protein  27.33 
 
 		 520 aa  87.8  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1405  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 519 aa  87.8  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.34 
 
 		 528 aa  87.4  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 504 aa  87  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>