More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1765 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  100 
 
 
471 aa  936    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  77.3 
 
 
473 aa  731    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  47.87 
 
 
475 aa  416  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  45.89 
 
 
502 aa  379  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  44.57 
 
 
487 aa  374  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  43.54 
 
 
491 aa  351  2e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  34.22 
 
 
477 aa  262  8e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 
472 aa  261  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  35.38 
 
 
470 aa  260  5.0000000000000005e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
474 aa  256  6e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  34.52 
 
 
477 aa  251  3e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  31.49 
 
 
473 aa  239  9e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0714  antibiotic resistance (efflux) protein, conjectural  75.4 
 
 
140 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.311349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  29.21 
 
 
485 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
494 aa  190  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  29.72 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  29.57 
 
 
523 aa  179  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
491 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
678 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  27.25 
 
 
506 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
482 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
499 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  31.92 
 
 
492 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
503 aa  167  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  29.51 
 
 
643 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  29.51 
 
 
643 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  29.51 
 
 
643 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  28.78 
 
 
476 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.61 
 
 
522 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  29 
 
 
650 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
484 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  29.02 
 
 
487 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  30.32 
 
 
504 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
512 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  30 
 
 
517 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
474 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 
494 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  29.04 
 
 
488 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.73 
 
 
515 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.96 
 
 
515 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
485 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.18 
 
 
449 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.52 
 
 
529 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 
529 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 
529 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
484 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
480 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 
697 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
474 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
492 aa  136  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.84 
 
 
534 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.17 
 
 
506 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.39 
 
 
592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.65 
 
 
537 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.88 
 
 
510 aa  133  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.3 
 
 
514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0464  major facilitator transporter  26.09 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.21 
 
 
579 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.57 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.15 
 
 
524 aa  131  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.67 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.67 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.67 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.13 
 
 
474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.67 
 
 
486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 
650 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 
569 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.67 
 
 
486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.67 
 
 
486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 
523 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.5 
 
 
524 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  27.71 
 
 
477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.87 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 
682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 
682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 
682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.63 
 
 
522 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.24 
 
 
543 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
487 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  25.43 
 
 
535 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  26.46 
 
 
483 aa  126  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.72 
 
 
526 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 
517 aa  126  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.99 
 
 
478 aa  126  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.89 
 
 
538 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.62 
 
 
531 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 
478 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 
484 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.2 
 
 
504 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  25.47 
 
 
530 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.68 
 
 
479 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.68 
 
 
479 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.48 
 
 
525 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 
478 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 
478 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.31 
 
 
532 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>