More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5274 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  886    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 494 aa  200  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 506 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 523 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 678 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  35.18 
 
 		 492 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 499 aa  172  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 503 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 		 512 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  28.54 
 
 		 485 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 457 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  33.7 
 
 		 487 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 517 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 643 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 643 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  30.3 
 
 		 643 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 479 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 650 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  29.26 
 
 		 476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 504 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 473 aa  143  7e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 464 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  29.34 
 
 		 489 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 449 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 482 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 487 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 484 aa  136  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.33 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 592 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 480 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 473 aa  130  7.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  31.07 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 502 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.49 
 
 		 526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  29.54 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.88 
 
 		 666 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.61 
 
 		 682 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 522 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.61 
 
 		 682 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.61 
 
 		 682 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  34.55 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 		 532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.34 
 
 		 528 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.9 
 
 		 534 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28 
 
 		 521 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.23 
 
 		 697 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  31.82 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.8 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.19 
 
 		 535 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 		 569 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.26 
 
 		 650 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 		 555 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.93 
 
 		 527 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 472 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.93 
 
 		 527 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  30.73 
 
 		 535 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 		 526 aa  106  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 487 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 531 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  28.4 
 
 		 487 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2369  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.52 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0464  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0115  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 		 685 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.92 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.06 
 
 		 480 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.2 
 
 		 524 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5607  drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  34 
 
 		 475 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864613  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 487 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.02 
 
 		 517 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  28.89 
 
 		 666 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  26.63 
 
 		 508 aa  103  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>