More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0887 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 494 aa  952    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  58.26 
 
 		 503 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  51.37 
 
 		 499 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 523 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  44.51 
 
 		 678 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  46.45 
 
 		 643 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 643 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  46.67 
 
 		 643 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  51.27 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  52.08 
 
 		 492 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 494 aa  359  7e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  49.58 
 
 		 512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  51.4 
 
 		 482 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  47.57 
 
 		 487 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  49.2 
 
 		 517 aa  345  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  39.46 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  45.95 
 
 		 504 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 650 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 492 aa  296  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 		 480 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  35.32 
 
 		 476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 482 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 		 484 aa  213  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  35.67 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 477 aa  203  7e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 487 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 548 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 487 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  36.83 
 
 		 487 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 487 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 479 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  33.4 
 
 		 498 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 		 474 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 475 aa  176  9e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 487 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  31.59 
 
 		 500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 473 aa  160  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  27.39 
 
 		 477 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 491 aa  146  7.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 		 528 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.93 
 
 		 522 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 463 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.16 
 
 		 504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 474 aa  131  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 470 aa  131  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  23.51 
 
 		 490 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.43 
 
 		 592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 		 520 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.74 
 
 		 635 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.8 
 
 		 537 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.14 
 
 		 515 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 607 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.49 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.7 
 
 		 658 aa  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  26.67 
 
 		 511 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 502 aa  119  7.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  29.08 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.74 
 
 		 528 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.45 
 
 		 539 aa  118  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 517 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.4 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.91 
 
 		 520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.44 
 
 		 522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  25.68 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.67 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.63 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.44 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.44 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  25.56 
 
 		 530 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.95 
 
 		 513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.69 
 
 		 513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  25.17 
 
 		 492 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.23 
 
 		 558 aa  113  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.23 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  23.54 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.37 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.49 
 
 		 492 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2125  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 507 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4010  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.6 
 
 		 519 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  26.52 
 
 		 529 aa  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.94 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 597 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.41 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>