More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0714 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0714  antibiotic resistance (efflux) protein, conjectural  100 
 
 		 140 aa  275  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.311349 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  74.62 
 
 		 473 aa  200  7e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  75.4 
 
 		 471 aa  199  9e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  59.69 
 
 		 475 aa  166  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  58.46 
 
 		 502 aa  161  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  55.81 
 
 		 487 aa  156  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  52.94 
 
 		 491 aa  147  6e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 477 aa  111  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  40.68 
 
 		 474 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 470 aa  107  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 473 aa  102  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 472 aa  97.1  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  40 
 
 		 477 aa  94.7  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 		 474 aa  93.6  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 491 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0464  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 450 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  31.78 
 
 		 476 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 494 aa  78.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 484 aa  77.4  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 517 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 482 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  31.4 
 
 		 492 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 484 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 		 545 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 457 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  37.62 
 
 		 477 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 650 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 464 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 523 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 488 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 678 aa  70.5  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  34.91 
 
 		 485 aa  70.5  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 504 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  33.33 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 506 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 487 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  32.17 
 
 		 492 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  30.65 
 
 		 398 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  37 
 
 		 476 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 474 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 512 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.79 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 492 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.86 
 
 		 650 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0867  RemN protein  35.19 
 
 		 558 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 489 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.78 
 
 		 682 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1575  hypothetical protein  44.78 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0379281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 460 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.78 
 
 		 682 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2964  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 464 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.413021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.78 
 
 		 682 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1154  hypothetical protein  38.18 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.5 
 
 		 527 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2086  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 547 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389714  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 473 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  29.25 
 
 		 500 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.97 
 
 		 522 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  38.18 
 
 		 582 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 405 aa  63.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 643 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  31.78 
 
 		 489 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 643 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  26.45 
 
 		 643 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2962  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.34 
 
 		 525 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.93 
 
 		 498 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 487 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.04 
 
 		 504 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.57 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1830  major facilitator superfamily drug efflux transporter  34.48 
 
 		 538 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 530 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  28.44 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  37.21 
 
 		 501 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  40 
 
 		 515 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 444 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.94 
 
 		 685 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.23 
 
 		 508 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 498 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 532 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  38 
 
 		 489 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.61 
 
 		 489 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.07 
 
 		 565 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 503 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.7 
 
 		 478 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 474 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 487 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3496  MFS transporter  36.05 
 
 		 531 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 487 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 482 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  31.62 
 
 		 487 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 487 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.29 
 
 		 482 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.89 
 
 		 607 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 480 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 396 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 480 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>