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for query gene Rpal_2086 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2086  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 547 aa  1072    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389714  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3058  major facilitator superfamily permease  67.56 
 
 		 527 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0549474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3496  MFS transporter  86.45 
 
 		 531 aa  803    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  83.46 
 
 		 530 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1794  major facilitator transporter  69.19 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0821089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1405  major facilitator transporter  67.7 
 
 		 519 aa  588  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1152  major facilitator transporter  61.38 
 
 		 516 aa  548  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0257451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2009  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1542  major facilitator superfamily MFS_1  42.77 
 
 		 498 aa  346  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1340  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 614 aa  346  8e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.407656  normal  0.251685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3490  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 503 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.691229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.67 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.8 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  40.91 
 
 		 535 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.51 
 
 		 483 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.27 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  40.38 
 
 		 501 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  38.21 
 
 		 515 aa  276  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.44 
 
 		 528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.72 
 
 		 505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.79 
 
 		 504 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.41 
 
 		 569 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 494 aa  269  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.79 
 
 		 498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.6 
 
 		 539 aa  263  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.77 
 
 		 526 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.77 
 
 		 526 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.36 
 
 		 666 aa  260  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.94 
 
 		 522 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.28 
 
 		 676 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.27 
 
 		 530 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 		 565 aa  253  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.23 
 
 		 535 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.89 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.7 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5086  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 529 aa  246  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  35.74 
 
 		 491 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.24 
 
 		 523 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.98 
 
 		 554 aa  244  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.98 
 
 		 680 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05301  integral membrane transmembrane protein  37.16 
 
 		 520 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.1 
 
 		 525 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.98 
 
 		 682 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.98 
 
 		 682 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.98 
 
 		 682 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.47 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.47 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.47 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.47 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 678 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.47 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.41 
 
 		 504 aa  237  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.63 
 
 		 650 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  35.83 
 
 		 513 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1000  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 531 aa  236  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.32 
 
 		 504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.23 
 
 		 504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.23 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.55 
 
 		 504 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 593 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.15 
 
 		 558 aa  233  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.75 
 
 		 509 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.75 
 
 		 509 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 592 aa  232  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.07 
 
 		 538 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 		 530 aa  232  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 		 567 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  35.64 
 
 		 537 aa  230  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.73 
 
 		 505 aa  231  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.7 
 
 		 504 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  34.94 
 
 		 477 aa  229  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 641 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.45 
 
 		 504 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 		 607 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.14 
 
 		 509 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 		 697 aa  227  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.24 
 
 		 509 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 		 512 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.63 
 
 		 523 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.18 
 
 		 592 aa  224  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 		 685 aa  223  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.2 
 
 		 519 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.71 
 
 		 504 aa  223  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.61 
 
 		 541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.15 
 
 		 565 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  33.17 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  33.17 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  35.02 
 
 		 539 aa  221  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
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NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.5 
 
 		 554 aa  221  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.54 
 
 		 672 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 478 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 512 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 478 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.56 
 
 		 918 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 478 aa  220  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.93 
 
 		 479 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.93 
 
 		 479 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_2618  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 484 aa  219  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.876226 
 
 
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