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for query gene Mchl_1542 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2009  major facilitator transporter  74.63 
 
 		 512 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1542  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 498 aa  965    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1340  major facilitator transporter  98.39 
 
 		 614 aa  945    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.407656  normal  0.251685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 530 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3490  major facilitator transporter  50.73 
 
 		 503 aa  353  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.691229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3058  major facilitator superfamily permease  43.81 
 
 		 527 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0549474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3496  MFS transporter  42.41 
 
 		 531 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1405  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 519 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2086  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 		 547 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389714  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1152  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 516 aa  332  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0257451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1794  major facilitator transporter  44.7 
 
 		 525 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0821089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.71 
 
 		 569 aa  311  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.27 
 
 		 528 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.67 
 
 		 539 aa  292  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.25 
 
 		 554 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.45 
 
 		 676 aa  279  6e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.82 
 
 		 565 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.11 
 
 		 535 aa  276  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  40.78 
 
 		 501 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.3 
 
 		 641 aa  273  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  39.71 
 
 		 515 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.78 
 
 		 538 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.87 
 
 		 567 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 		 697 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.66 
 
 		 685 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.76 
 
 		 535 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  38.07 
 
 		 537 aa  266  5e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.84 
 
 		 504 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 		 504 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 		 504 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.49 
 
 		 519 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.41 
 
 		 504 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.8 
 
 		 666 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.22 
 
 		 504 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.22 
 
 		 504 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.24 
 
 		 558 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 		 504 aa  263  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.49 
 
 		 504 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.02 
 
 		 526 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.02 
 
 		 526 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.69 
 
 		 607 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.36 
 
 		 504 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.25 
 
 		 509 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.38 
 
 		 538 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.25 
 
 		 509 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.54 
 
 		 541 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.85 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.38 
 
 		 593 aa  259  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 		 504 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.11 
 
 		 504 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 		 682 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 		 682 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 		 682 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 		 678 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.91 
 
 		 532 aa  257  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.69 
 
 		 504 aa  257  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.91 
 
 		 520 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.26 
 
 		 530 aa  256  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.29 
 
 		 505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.4 
 
 		 483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.86 
 
 		 565 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.34 
 
 		 522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.72 
 
 		 685 aa  255  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.63 
 
 		 504 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.6 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  38.17 
 
 		 513 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 		 685 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 		 528 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.79 
 
 		 509 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.18 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 491 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.77 
 
 		 483 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 		 650 aa  250  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 		 525 aa  249  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_003296  RS05301  integral membrane transmembrane protein  37.72 
 
 		 520 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.26 
 
 		 526 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.99 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.15 
 
 		 680 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  41.62 
 
 		 666 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.88 
 
 		 537 aa  247  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.33 
 
 		 514 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.9 
 
 		 575 aa  246  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.24 
 
 		 561 aa  246  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.39 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B5086  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190759  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.66 
 
 		 672 aa  243  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.04 
 
 		 555 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.14 
 
 		 557 aa  239  8e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
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NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.9 
 
 		 528 aa  239  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.82 
 
 		 592 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.51 
 
 		 890 aa  237  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 		 505 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
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NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 511 aa  236  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 		 538 aa  236  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 539 aa  236  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
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NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 539 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.9 
 
 		 519 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 		 523 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
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