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for query gene Bind_3490 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3490  major facilitator transporter  100 
 
 		 503 aa  983    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.691229 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2009  major facilitator transporter  50.1 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1542  major facilitator superfamily MFS_1  51.05 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1340  major facilitator transporter  50.73 
 
 		 614 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.407656  normal  0.251685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 530 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1405  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 519 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3058  major facilitator superfamily permease  40.44 
 
 		 527 aa  325  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0549474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3496  MFS transporter  42.66 
 
 		 531 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1152  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 516 aa  323  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0257451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2086  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 		 547 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1794  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0821089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.05 
 
 		 539 aa  290  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.05 
 
 		 569 aa  281  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.86 
 
 		 528 aa  280  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.69 
 
 		 567 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 		 554 aa  261  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.25 
 
 		 565 aa  259  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.95 
 
 		 504 aa  259  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.59 
 
 		 504 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.04 
 
 		 641 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 494 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.17 
 
 		 509 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.17 
 
 		 509 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.19 
 
 		 525 aa  253  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.38 
 
 		 666 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 		 538 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.31 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.85 
 
 		 523 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.17 
 
 		 504 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.63 
 
 		 509 aa  250  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.89 
 
 		 504 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.33 
 
 		 504 aa  249  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.13 
 
 		 680 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.74 
 
 		 504 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.95 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.07 
 
 		 528 aa  248  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 		 682 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 		 682 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 		 682 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.85 
 
 		 519 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.9 
 
 		 572 aa  246  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 491 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.73 
 
 		 535 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.02 
 
 		 504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.99 
 
 		 592 aa  245  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.45 
 
 		 522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.37 
 
 		 504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.13 
 
 		 504 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.13 
 
 		 504 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.13 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.69 
 
 		 532 aa  243  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.13 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.87 
 
 		 530 aa  243  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.13 
 
 		 504 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.84 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
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NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.84 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.05 
 
 		 697 aa  240  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.39 
 
 		 593 aa  239  8e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 		 483 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.28 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.21 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 		 557 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.83 
 
 		 483 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.03 
 
 		 528 aa  236  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.83 
 
 		 483 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.3 
 
 		 678 aa  236  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.81 
 
 		 676 aa  236  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  36.02 
 
 		 515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 		 526 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  36.41 
 
 		 501 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.36 
 
 		 528 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  35.84 
 
 		 537 aa  234  3e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 539 aa  233  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.94 
 
 		 541 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.74 
 
 		 575 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 530 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.6 
 
 		 519 aa  233  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 512 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 512 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.89 
 
 		 505 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.55 
 
 		 685 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1000  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 531 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  34.91 
 
 		 513 aa  230  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 		 555 aa  230  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.86 
 
 		 1062 aa  229  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.93 
 
 		 478 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  34.69 
 
 		 478 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  34.93 
 
 		 478 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.86 
 
 		 685 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.54 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  33.87 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.66 
 
 		 592 aa  227  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 501 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.69 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.53 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.53 
 
 		 918 aa  227  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 		 562 aa  226  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 		 478 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 		 478 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
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