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for query gene RPC_1794 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3496  MFS transporter  70.17 
 
 
531 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597192  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1794  major facilitator transporter  100 
 
 
525 aa  1019    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0821089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  72.08 
 
 
530 aa  689    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2086  major facilitator superfamily MFS_1  69.94 
 
 
547 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389714  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3058  major facilitator superfamily permease  63.89 
 
 
527 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0549474  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1405  major facilitator transporter  66.73 
 
 
519 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1152  major facilitator transporter  63.88 
 
 
516 aa  557  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0257451  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2009  major facilitator transporter  45.64 
 
 
512 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1542  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 
498 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1340  major facilitator transporter  43.83 
 
 
614 aa  329  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.407656  normal  0.251685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3490  major facilitator transporter  45.76 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.691229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.13 
 
 
483 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.6 
 
 
483 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  35.05 
 
 
515 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.13 
 
 
505 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  37.87 
 
 
501 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.81 
 
 
535 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.97 
 
 
498 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 
483 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.52 
 
 
483 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.47 
 
 
504 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.04 
 
 
528 aa  266  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 
526 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 
526 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 
569 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  37.37 
 
 
494 aa  259  8e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 
539 aa  257  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 
676 aa  256  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05301  integral membrane transmembrane protein  38.49 
 
 
520 aa  256  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.07 
 
 
565 aa  250  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.58 
 
 
530 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37 
 
 
680 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.63 
 
 
666 aa  246  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  35.89 
 
 
513 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.04 
 
 
593 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.97 
 
 
525 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 
522 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.24 
 
 
528 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.78 
 
 
535 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.9 
 
 
592 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 
491 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.95 
 
 
523 aa  236  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5086  major facilitator transporter  38.69 
 
 
529 aa  236  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 
554 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.56 
 
 
678 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.82 
 
 
523 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.88 
 
 
528 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.82 
 
 
504 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.74 
 
 
561 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.59 
 
 
504 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.59 
 
 
504 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.59 
 
 
504 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.59 
 
 
504 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.44 
 
 
641 aa  229  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 
512 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.26 
 
 
509 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.26 
 
 
509 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.28 
 
 
519 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.59 
 
 
519 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 
504 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.56 
 
 
558 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.35 
 
 
504 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.35 
 
 
504 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 
530 aa  226  8e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.8 
 
 
504 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 
509 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 
650 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 
607 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
512 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.74 
 
 
682 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36 
 
 
538 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 
682 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 
682 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 
504 aa  224  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.95 
 
 
500 aa  224  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.32 
 
 
672 aa  223  6e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 
513 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 
685 aa  223  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
697 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.82 
 
 
504 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.43 
 
 
501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.6 
 
 
520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1177  MFS permease  34.29 
 
 
520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.95 
 
 
524 aa  221  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.84 
 
 
514 aa  221  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 
505 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
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NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  36.32 
 
 
537 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.63 
 
 
555 aa  220  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1000  major facilitator transporter  39.55 
 
 
531 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.56 
 
 
509 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
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NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 
565 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.1 
 
 
685 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  32.89 
 
 
477 aa  217  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.65 
 
 
890 aa  217  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal 
 
 
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NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.55 
 
 
685 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
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NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 
584 aa  217  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  35.66 
 
 
666 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  33.03 
 
 
1062 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.04 
 
 
538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.88 
 
 
476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
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