More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0273 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  786    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 391 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  33.6 
 
 		 386 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  34.22 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 385 aa  136  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 439 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  23.88 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  24.01 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  23.38 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 474 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  25.75 
 
 		 409 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.34 
 
 		 587 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 		 511 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 553 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  23.77 
 
 		 518 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  34.34 
 
 		 582 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.61 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  25.63 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  27.15 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  31.34 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  27.22 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.11 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.11 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  27.03 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  27.03 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  26.76 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.34 
 
 		 524 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.46 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.76 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1199  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.76 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.21 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  28.26 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4805  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.19 
 
 		 685 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.84 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3171  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.76 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.76 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.88 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  25.13 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1079  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  29.31 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0013428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.35 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.51 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.61 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.61 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1382  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.229793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.61 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  23.37 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4472  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.07 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238318  normal  0.949404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.86 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  28.1 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  27.53 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.57 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  34.48 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.13 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  25.47 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  25 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  33.79 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.58 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.86 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.46 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4010  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.07 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.78 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>