More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0867 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0867  RemN protein  100 
 
 		 558 aa  997    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  97.26 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  87.98 
 
 		 553 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.72 
 
 		 587 aa  293  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0302  RemN protein  99.16 
 
 		 119 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  78.95 
 
 		 521 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  77.44 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  81.89 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  81.89 
 
 		 518 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  81.1 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  57.85 
 
 		 511 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  56.39 
 
 		 510 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.33 
 
 		 504 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.35 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.24 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  48.8 
 
 		 476 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.96 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.59 
 
 		 527 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 528 aa  102  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.15 
 
 		 469 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.8 
 
 		 489 aa  100  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.6 
 
 		 532 aa  100  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.04 
 
 		 508 aa  98.2  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 483 aa  97.8  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 483 aa  97.8  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 469 aa  97.4  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 397 aa  97.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 468 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 468 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  41.88 
 
 		 1065 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.64 
 
 		 487 aa  96.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 480 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 		 494 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 498 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.58 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.44 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.63 
 
 		 763 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  43.33 
 
 		 543 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 463 aa  94.7  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.44 
 
 		 504 aa  94.7  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.9 
 
 		 527 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 468 aa  94.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 476 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 476 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 497 aa  94  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 474 aa  93.6  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.31 
 
 		 502 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 472 aa  93.6  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 491 aa  93.6  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.06 
 
 		 507 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.93 
 
 		 520 aa  93.6  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 485 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  43.7 
 
 		 579 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 480 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 1112 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.41 
 
 		 522 aa  92.8  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.54 
 
 		 646 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.6 
 
 		 583 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.54 
 
 		 646 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.41 
 
 		 527 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  41.55 
 
 		 497 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 574 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.54 
 
 		 646 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.86 
 
 		 609 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.48 
 
 		 627 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.01 
 
 		 485 aa  90.5  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.86 
 
 		 511 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 523 aa  90.1  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.35 
 
 		 504 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.67 
 
 		 458 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1354  putative export protein  36.22 
 
 		 498 aa  89.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.44 
 
 		 548 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.77 
 
 		 534 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.68 
 
 		 521 aa  89.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.75 
 
 		 494 aa  88.6  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  40 
 
 		 503 aa  88.6  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  43.12 
 
 		 450 aa  88.6  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3691  putative transmembrane efflux protein  45.11 
 
 		 459 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 504 aa  87.8  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.59 
 
 		 483 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 		 513 aa  88.2  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.86 
 
 		 521 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.6 
 
 		 512 aa  87.8  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.15 
 
 		 490 aa  87.4  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 519 aa  87.4  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 488 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 488 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 479 aa  87.4  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 		 540 aa  87  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.48 
 
 		 520 aa  87  8e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.19 
 
 		 480 aa  87  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  45.19 
 
 		 480 aa  87  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.19 
 
 		 480 aa  87  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>