More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1154 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0867  RemN protein  100 
 
 		 558 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  470  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  100 
 
 		 582 aa  360  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  90.45 
 
 		 553 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  81.77 
 
 		 587 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0302  RemN protein  99.16 
 
 		 119 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  79.55 
 
 		 521 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  78.03 
 
 		 532 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  85.59 
 
 		 523 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  85.59 
 
 		 518 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  84.75 
 
 		 519 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  56.45 
 
 		 511 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 514 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  58.06 
 
 		 510 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.33 
 
 		 504 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  48.06 
 
 		 483 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  48.82 
 
 		 476 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.35 
 
 		 478 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.96 
 
 		 478 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.93 
 
 		 527 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.24 
 
 		 539 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 528 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.73 
 
 		 532 aa  102  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 		 494 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.8 
 
 		 469 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.14 
 
 		 487 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 397 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 468 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.07 
 
 		 508 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 468 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.6 
 
 		 452 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  39.87 
 
 		 480 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  43.33 
 
 		 543 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  49.56 
 
 		 469 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 476 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 476 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.34 
 
 		 534 aa  99  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 494 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  42 
 
 		 476 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 483 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 483 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 485 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 491 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 498 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.28 
 
 		 527 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 497 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.7 
 
 		 763 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.27 
 
 		 489 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 463 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  45.22 
 
 		 468 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.75 
 
 		 494 aa  96.7  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 574 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 472 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.41 
 
 		 522 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 480 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  43.94 
 
 		 497 aa  95.9  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 474 aa  95.5  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.93 
 
 		 520 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3691  putative transmembrane efflux protein  46.15 
 
 		 459 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.65 
 
 		 502 aa  95.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.74 
 
 		 534 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1354  putative export protein  35.34 
 
 		 498 aa  94.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.4 
 
 		 507 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.86 
 
 		 511 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.13 
 
 		 512 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  43.09 
 
 		 579 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.21 
 
 		 485 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 505 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.85 
 
 		 504 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.67 
 
 		 458 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.9 
 
 		 527 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.31 
 
 		 521 aa  93.6  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  42.98 
 
 		 450 aa  93.2  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 		 540 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  42.4 
 
 		 1065 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2027  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 		 506 aa  93.6  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 504 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 512 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.96 
 
 		 519 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  48.06 
 
 		 506 aa  92.8  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.57 
 
 		 493 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 		 463 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.73 
 
 		 474 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.27 
 
 		 609 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.58 
 
 		 504 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  44.03 
 
 		 492 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 515 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 512 aa  91.7  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  40.28 
 
 		 479 aa  91.7  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.9 
 
 		 646 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.9 
 
 		 646 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.19 
 
 		 480 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.19 
 
 		 480 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  40.87 
 
 		 537 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 512 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 512 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.19 
 
 		 480 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  45.19 
 
 		 480 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.19 
 
 		 480 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.9 
 
 		 646 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>