More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2070 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  100 
 
 		 502 aa  989    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  54.02 
 
 		 487 aa  530  1e-149  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  50.92 
 
 		 491 aa  451  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 471 aa  413  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  41.2 
 
 		 475 aa  371  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 477 aa  290  6e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 470 aa  281  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 474 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 473 aa  264  3e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 477 aa  262  8.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 491 aa  193  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 474 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0464  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 450 aa  177  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 678 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 506 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  27.04 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0714  antibiotic resistance (efflux) protein, conjectural  58.46 
 
 		 140 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.311349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 643 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  28.1 
 
 		 643 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 643 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 484 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  28.54 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 503 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 517 aa  153  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.01 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.5 
 
 		 522 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 494 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 		 515 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.83 
 
 		 523 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.18 
 
 		 569 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  27.56 
 
 		 476 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 480 aa  143  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 650 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  28 
 
 		 483 aa  140  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 474 aa  140  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.41 
 
 		 504 aa  140  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 485 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 512 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.48 
 
 		 680 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  27.81 
 
 		 487 aa  136  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.98 
 
 		 480 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.57 
 
 		 449 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.93 
 
 		 537 aa  133  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.87 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.87 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  28.83 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.72 
 
 		 496 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  29.09 
 
 		 683 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 539 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.87 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  26.62 
 
 		 478 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  26.62 
 
 		 478 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.87 
 
 		 479 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.87 
 
 		 479 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.17 
 
 		 522 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 682 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 682 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 682 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.37 
 
 		 478 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.54 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.65 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.46 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.63 
 
 		 592 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 		 504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.59 
 
 		 513 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.59 
 
 		 513 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 		 558 aa  128  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.94 
 
 		 697 aa  128  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 509 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  27.93 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.53 
 
 		 509 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  26.34 
 
 		 489 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 		 511 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.59 
 
 		 513 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  27.59 
 
 		 513 aa  126  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  27.59 
 
 		 513 aa  126  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 		 509 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 		 509 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26 
 
 		 525 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.65 
 
 		 513 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 		 478 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.65 
 
 		 513 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.53 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  28.32 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.34 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3480  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4552  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>