More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4178 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
503 aa  970    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  60.14 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  51.08 
 
 
523 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  52.98 
 
 
499 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  48.91 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  50.64 
 
 
517 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  49.46 
 
 
487 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  52.03 
 
 
457 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 
494 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  47.78 
 
 
643 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  47.78 
 
 
643 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  47.78 
 
 
643 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
512 aa  365  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  48.93 
 
 
492 aa  362  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  42.95 
 
 
678 aa  356  6.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  51.9 
 
 
504 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  50.47 
 
 
482 aa  345  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 
492 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  36.67 
 
 
485 aa  306  6e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 
480 aa  299  9e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  44.47 
 
 
650 aa  297  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 
491 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  36.64 
 
 
476 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 
484 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  33.48 
 
 
479 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  34.65 
 
 
489 aa  216  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  27.21 
 
 
477 aa  212  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 
485 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  32.51 
 
 
488 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 
482 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 
474 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 
487 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  36.57 
 
 
487 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  36.57 
 
 
487 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  36.57 
 
 
487 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 
498 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
475 aa  180  7e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  34.56 
 
 
548 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  27.93 
 
 
477 aa  177  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.46 
 
 
592 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  29.13 
 
 
471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
472 aa  174  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 
449 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  30.25 
 
 
477 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 
472 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
487 aa  167  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  30.12 
 
 
491 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 
474 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  31.37 
 
 
500 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 
607 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 
484 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  27.33 
 
 
473 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 
534 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  29.16 
 
 
473 aa  155  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
463 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.55 
 
 
635 aa  146  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.58 
 
 
514 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  27.49 
 
 
502 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.78 
 
 
521 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  28.21 
 
 
470 aa  140  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.18 
 
 
579 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.31 
 
 
528 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.31 
 
 
539 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 
530 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.43 
 
 
522 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  30.13 
 
 
483 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 
650 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.84 
 
 
697 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2125  major facilitator transporter  27.27 
 
 
507 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.86 
 
 
529 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 
474 aa  133  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.29 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.65 
 
 
513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.01 
 
 
513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.65 
 
 
513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.47 
 
 
513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.01 
 
 
513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  27.51 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.65 
 
 
513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  25.65 
 
 
513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  25.65 
 
 
513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.17 
 
 
513 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.17 
 
 
513 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.38 
 
 
515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.18 
 
 
515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.68 
 
 
520 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.71 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.7 
 
 
685 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.14 
 
 
529 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.79 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.57 
 
 
537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 
517 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.35 
 
 
570 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.77 
 
 
658 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 
539 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.63 
 
 
504 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.5 
 
 
512 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.94 
 
 
509 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 
682 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 
682 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>