More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3397 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  70.1 
 
 		 523 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  100 
 
 		 504 aa  958    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  76.36 
 
 		 517 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  52.22 
 
 		 506 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  52.84 
 
 		 643 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  52.84 
 
 		 643 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  52.62 
 
 		 643 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  58.13 
 
 		 492 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  56.33 
 
 		 457 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  53.75 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 		 494 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  56.9 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  52.7 
 
 		 487 aa  398  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 		 678 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  46.03 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  51.25 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  45.44 
 
 		 492 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 650 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  46.64 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  40.66 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 		 494 aa  313  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 		 491 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 484 aa  236  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  39.16 
 
 		 485 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  37.39 
 
 		 476 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 		 487 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 		 474 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 477 aa  203  5e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 498 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  32.47 
 
 		 489 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 482 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 487 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  34.99 
 
 		 487 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 473 aa  183  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.25 
 
 		 449 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 487 aa  176  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 475 aa  176  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 548 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  28 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 484 aa  163  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  30.57 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 502 aa  160  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  33.5 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 470 aa  147  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  31.67 
 
 		 483 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 514 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.61 
 
 		 534 aa  135  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.05 
 
 		 592 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 		 501 aa  131  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.98 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.4 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.08 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.53 
 
 		 538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 474 aa  128  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.92 
 
 		 522 aa  128  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.02 
 
 		 504 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 		 541 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.47 
 
 		 510 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.53 
 
 		 528 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  28.12 
 
 		 535 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.45 
 
 		 524 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.99 
 
 		 477 aa  124  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0115  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 554 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.19 
 
 		 524 aa  123  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 471 aa  123  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.25 
 
 		 534 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.96 
 
 		 569 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.26 
 
 		 539 aa  121  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.57 
 
 		 579 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 		 593 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 		 666 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.76 
 
 		 498 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.65 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 532 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 509 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.47 
 
 		 541 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.11 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.42 
 
 		 539 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.32 
 
 		 561 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 658 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.36 
 
 		 685 aa  117  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  32.64 
 
 		 537 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4687  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.74 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>