More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6965 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  100 
 
 		 548 aa  1043    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  51.87 
 
 		 498 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  45.64 
 
 		 472 aa  265  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 678 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 494 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  35.99 
 
 		 485 aa  236  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 506 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 523 aa  226  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 512 aa  220  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  37.29 
 
 		 492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  36.14 
 
 		 487 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 		 473 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 643 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  36.32 
 
 		 643 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 643 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 499 aa  212  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 503 aa  210  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  36.38 
 
 		 476 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 485 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  36.28 
 
 		 482 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 650 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 		 487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 504 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.97 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  34.78 
 
 		 489 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 		 474 aa  170  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 487 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  34.05 
 
 		 487 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 487 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 487 aa  141  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  32.34 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  32.83 
 
 		 500 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.74 
 
 		 528 aa  136  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 		 569 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.98 
 
 		 525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1000  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 531 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 		 593 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 477 aa  124  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  27.94 
 
 		 537 aa  123  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.98 
 
 		 685 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 464 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 		 680 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.99 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.74 
 
 		 676 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.68 
 
 		 522 aa  117  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 		 523 aa  117  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 682 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.18 
 
 		 571 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 682 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.71 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 682 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.89 
 
 		 678 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.19 
 
 		 592 aa  115  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.07 
 
 		 522 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.16 
 
 		 514 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.61 
 
 		 475 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.95 
 
 		 557 aa  113  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.46 
 
 		 539 aa  113  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.34 
 
 		 657 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.97 
 
 		 918 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.93 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.47 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  32.41 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 		 641 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.35 
 
 		 565 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.89 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2523  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 551 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.55 
 
 		 475 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  26.8 
 
 		 1062 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 		 650 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 		 555 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.92 
 
 		 516 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 		 504 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>