More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3140 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  82.11 
 
 		 489 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  100 
 
 		 479 aa  929    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  75.16 
 
 		 487 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  75.16 
 
 		 487 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  75.37 
 
 		 487 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  45.56 
 
 		 482 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 523 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 506 aa  236  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 494 aa  233  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 678 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  37.22 
 
 		 476 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  35.89 
 
 		 492 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 487 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 488 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 491 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  32.2 
 
 		 485 aa  216  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  35.76 
 
 		 487 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 512 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 643 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  34.86 
 
 		 643 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 643 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 492 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 650 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 477 aa  196  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 494 aa  190  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 517 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 498 aa  179  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 548 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  30.33 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  30.02 
 
 		 483 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 487 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  28.64 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 473 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4580  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 473 aa  127  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0082  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0186  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.95 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 522 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 470 aa  113  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.88 
 
 		 515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.2 
 
 		 666 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.12 
 
 		 592 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.11 
 
 		 510 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  23.93 
 
 		 507 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.85 
 
 		 505 aa  110  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.96 
 
 		 523 aa  109  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  27.2 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.3 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.52 
 
 		 537 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.84 
 
 		 532 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.92 
 
 		 528 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04410  arabinose efflux permease family protein  28.54 
 
 		 472 aa  107  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.684912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.96 
 
 		 593 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  23.93 
 
 		 507 aa  107  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 		 524 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.85 
 
 		 515 aa  106  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 607 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.85 
 
 		 676 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.82 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  26.23 
 
 		 666 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  26.42 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.9 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.77 
 
 		 525 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.81 
 
 		 685 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.36 
 
 		 517 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.29 
 
 		 549 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.74 
 
 		 555 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.17 
 
 		 522 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.7 
 
 		 850 aa  103  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.59 
 
 		 478 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  28.29 
 
 		 531 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  28.29 
 
 		 531 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.95 
 
 		 534 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.59 
 
 		 484 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>